Đến năm 2019, xã Gia Phú có diện tích 78,28 km², dân số là 15.505 người, mật độ dân số đạt 198 người/km².

Ngày 11 tháng 2 năm 2020, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết số 896/NQ-UBTVQH14 về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp huyện, cấp xã thuộc tỉnh Lào Cai (nghị quyết có hiệu lực từ ngày 1 tháng 3 năm 2020)[2]. Theo đó, điều chỉnh 33,09 km² diện tích tự nhiên và 7.142 người thuộc 15 thôn: Bản Cam, Khe Luộc, An Thành, Mường Bát, Phú Hùng, Cắp Kẹ, Muồng, Chang, Hòa Lạc, Tiến Thắng, Thái Bo, Giao Ngay, Tiến Cường, Tân Tiến, Giao Tiến của xã Gia Phú vào thành phố Lào Cai.

Sau khi điều chỉnh, xã Gia Phú có diện tích 45,19 km², dân số là 8.363 người.